【2026年最新】会計・経理API料金比較｜freee・マネーフォワード・Stripe・Square
AIエージェントナビ編集部
はじめに
会計・経理・決済APIとは？
会計・経理・決済APIとは、請求書の発行・経費の仕訳・オンライン決済処理などをプログラムから行うためのインターフェースです。AIエージェントと組み合わせると、売上の自動仕訳・月次レポートの自動生成・請求書の自動作成・決済リンクの自動発行など、経理業務を大きく自動化できます。
本ページでは、国内で広く使われている会計SaaS（freee会計・マネーフォワード クラウド）と、決済API（Stripe・Square）の4サービスを、料金体系・テスト環境・MCPサーバー対応の3点で比較します。決済まで含めるのは、「決済が成立したら売上を仕訳する」という流れをAIエージェントに任せる場面が増えているためです。
会計SaaS系APIと決済API（Stripe・Square）の違い
- 会計SaaS系API（freee・マネーフォワード）：請求書作成・経費記録・仕訳・給与計算などの会計業務を自動化。API利用に追加料金はなく、SaaSのサブスク月額だけがコスト。
- 決済API（Stripe・Square）：クレジットカード決済・サブスク請求・決済リンクなどの資金移動を処理。API利用は無料で、決済が成立したときだけ手数料が発生する従量課金モデル。
この表の見方
- カテゴリ：会計SaaS（月額課金）か、決済API（手数料課金）か
- テスト環境：本番契約なしで開発・テストできるか（「トライアルのみ」＝本番の無料期間で試す）
- 費用目安：最安プランの月額（税抜）、または決済1件あたりの手数料
- MCP対応：AIエージェント（Claude等）から直接操作できるMCPサーバーが公式に提供されているか（◎＝公式提供）
会計・経理・決済API料金比較表（2026年9月時点）
※料金は税抜・2026年9月時点の情報です。
| サービス | カテゴリ | 料金体系 | テスト環境 | 費用目安 | AI自動化用途 | MCP対応 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| freee 会計 | 会計SaaS | SaaSサブスク月額（API無料） | ✓ あり（開発用テスト事業所・無料） | スターター ¥5,480/月〜（年払い） | 請求書作成・経費記録・仕訳自動化 | ◎（公式OSS＋リモート） |
| マネーフォワード クラウド | 会計SaaS | SaaSサブスク月額（API無料） | トライアルのみ（1ヶ月） | ひとり法人 ¥2,480/月〜（年払い・月払い¥3,980） | 請求書作成・経費記録・売掛管理 | ◎（公式リモート・全プラン） |
| Stripe | 決済API | API無料 ＋ 決済手数料のみ | ✓ あり（サンドボックス） | オンライン決済 3.6%/件〜 | 決済処理・サブスク請求・請求書発行 | ◎（公式リモート） |
| Square | 決済API | API無料 ＋ 決済手数料のみ | ✓ あり（サンドボックス・無料） | 対面 2.5%〜／非対面 3.75%/件 | 店舗決済・eコマース・予約決済 | ◎（公式リモート・ベータ） |
※ freee：APIは全プランで利用可（最安「ひとり法人」¥2,980/月〜、上位「アドバンス」¥39,780/月）。上限超過は429で通知。
※ マネーフォワード：API経由の見積書・請求書はひとり法人/スモールで月100件、ビジネス（¥6,480/月）で無制限。
※ Stripe：通貨換算+2%。コンビニ3.6%（最低¥120）・銀行振込1.5%・対面3.24%。
※ Square：対面2.5%は年3,000万円未満・主要ブランドの場合（他は3.25%〜）。オンライン3.6%・請求書3.25%。
出典：freee 公式料金ページ
出典：マネーフォワード 公式料金ページ
出典：Stripe 公式料金ページ
出典：Square 公式料金ページ
料金・要確認
- freeeのAPIコール上限（プラン別の1日あたり回数）：公式の料金ページ・ヘルプ・開発者向けリファレンスで確認できなかったため掲載していません（公式が明記するのは過度なアクセス時の403＝約10分後に再開と、エンドポイントごとの429）。
- Squareの海外発行カード加算（1.5%）：米国版ヘルプの記載で、日本の料金ページには無いため断定していません。
用途別おすすめ
AIエージェントで請求書・経費処理を自動化したい
freee 会計APIまたはマネーフォワード クラウド会計が最適です。どちらも公式のリモートMCPサーバーがあり、Claude等のAIエージェントから自然言語で会計業務を操作できます。
freeeは会計・人事労務・請求書・工数管理・販売などのPublic APIを提供し、公式MCPサーバー「freee-mcp」をOSS（Apache-2.0）で公開しています（2026年9月時点のREADMEで10プロダクト・485操作）。2026年3月27日からはリモート版（mcp.freee.co.jp/mcp）も提供され、ローカル環境の構築なしにClaude.ai・Claude Desktopの公式コネクタからも接続できます。
マネーフォワード クラウド会計は2026年3月26日から全プランでリモートMCPサーバーを提供しており、クラウド会計を利用中なら追加料金はかかりません。仕訳の取得・新規作成・更新、残高試算表と推移表の取得、入出金明細からの仕訳作成に対応し、Claude Desktop・Claude Code・Cursorなどから利用できます。利用にはアプリポータルの有効化と「全権管理」権限が必要です。
低コストから会計APIを始めたい
マネーフォワード クラウドが向いています。ひとり法人プランの¥2,480/月（年払い・月払いは¥3,980）は会計SaaSの中でも低価格帯で、APIによる請求書作成が月100件以内なら対応できます。ただし仕訳は500件/会計年度までのため、取引が多い場合はスモールビジネス（¥4,480/月・年払い）以上を検討してください。freeeにも記帳専用の「ひとり法人」¥2,980/月（年払い）があり、Public APIは会計の全プランで使えます。
ECサイト・SaaSのオンライン決済を自動化したい
Stripeが業界標準です。初期費用・月額料金なし・API利用無料で、カード決済が成功したときだけ3.6%が発生するため、販売実績がゼロの時期はコストがかかりません。AIエージェントからは、サブスク料金の自動請求・決済リンクの生成・請求書の発行に使われます。公式リモートMCPサーバー（mcp.stripe.com）は顧客・支払い・請求書・サブスク・商品と価格・決済リンクなどの読み書きに対応し、OAuthで認可するためAPIキーをAIツールに渡さずに済みます。
実店舗とオンラインの決済を一元管理したい
Squareが向いています。対面決済は年間キャッシュレス決済額3,000万円未満・主要カードブランドなら2.5%と低く、カードリーダーとAPIを組み合わせれば、AIによる在庫管理・予約管理と連動した決済処理が実現できます。オンライン（eコマースAPI）3.6%・非対面3.75%・請求書決済3.25%で、実店舗とオンラインの売上を1つのプラットフォームで管理できます。公式MCPサーバー（mcp.squareup.com/mcp）はベータ提供で、顧客・注文・商品などSquare APIに接続できます。
よくある質問
freeeとマネーフォワードはどちらがAI連携に向いていますか？
どちらも公式のリモートMCPサーバーがあり、AIエージェントから自然言語で操作できます。freeeは「freee-mcp」をOSSで公開し10プロダクト485操作に対応（2026年9月時点のREADME）、マネーフォワード クラウド会計は2026年3月から全プラン・追加料金なしで仕訳の作成・更新や残高試算表の取得ができます。導入コストを抑えたいならマネーフォワード（¥2,480/月〜）、操作できるAPIの幅を重視するならfreeeが向いています。
StripeとSquareの決済手数料はどちらが安いですか？
用途で分かれます。オンライン決済はStripe 3.6%とSquareのeコマースAPI 3.6%で同率、カード情報を手入力する非対面決済はSquare 3.75%です。対面（店舗）決済はSquareが2.5%（年間キャッシュレス決済額3,000万円未満・主要カードブランド）で、StripeのTerminal 3.24%より低くなります。どちらも月額固定費なし・API利用無料で、決済が成立するまでコストはかかりません。
会計APIと決済APIは別々に契約が必要ですか？
はい。会計SaaS（freee・マネーフォワード）と決済API（Stripe・Square）は役割が異なるサービスで、それぞれ契約が必要です。ただし連携は可能で、「Stripeで決済が完了したらfreeeに売上を仕訳する」といったワークフローをAIエージェントで組めます。
AIエージェントで自動仕訳はできますか？
できます。freee-mcpなら「先月のクレジットカード明細を仕訳して」といった自然言語の指示で処理でき、マネーフォワード クラウド会計のMCPサーバーも仕訳の新規作成・更新・入出金明細からの仕訳作成に対応しています。税務上の正確性はAIが保証しないため、最終確認は経理担当者または税理士が行ってください。
契約前にAPIを無料で試せますか？
freeeはfreee Developers Communityで開発用テスト事業所を無料で作成でき、本番契約なしでAPIを試せます（90日間API実行がない事業所は定期削除されますが、無料で作り直せます）。マネーフォワード クラウドは専用のテスト環境がなく、1ヶ月の無料トライアルで試す形です（終了後に自動で有料プランへ移行することはありません）。APIの利用はマネーフォワード クラウド Developersでのアプリ登録から始めます。StripeとSquareはサンドボックスが無料で、実際の資金を動かさずに決済フローをテストできます（Squareは呼び出し回数も無制限）。
各社のMCPサーバーはどこに接続すればよいですか？
4社とも公式のリモートMCPサーバーがあり、AIツールの設定にURLを追加するだけで使えます。freeeは mcp.freee.co.jp/mcp、マネーフォワード クラウド会計は beta.mcp.developers.biz.moneyforward.com/mcp/ca/v3、Stripeは mcp.stripe.com、Squareは mcp.squareup.com/mcp（ベータ）です。いずれも各サービスへのログイン（OAuth）で認証します。
関連記事：【比較検証】会計MCPサーバー3選｜AIで帳簿入力から試算表確認まで自動化する方法
まとめ
会計SaaS（freee・マネーフォワード）は月額課金でAPIは追加料金なし、決済API（Stripe・Square）はAPI無料で決済成立時のみ手数料という2つの型に分かれます。2026年9月時点で4社すべてが公式のリモートMCPサーバーを提供しており、AIエージェントから「請求書を作る」「決済リンクを発行する」「売上を仕訳する」までを一つの流れで組めます。会計はfreee（API・MCPの幅）かマネーフォワード（¥2,480/月〜）、決済はオンライン中心ならStripe、実店舗を含むならSquare（対面2.5%〜）を起点に選ぶのが目安です。料金は本ページの出典（各社公式ページ）で最新の表示を確認してください。
